A templom orgonája többszöri átépítés után 1774-ben készült el. Először Standiger János budai orgonaépítőt bízták meg (1728). A sípszekrény két oldalán egy-egy angyal trombitás alakja volt látható. 1761-ben alakítja át Jancsik József pesti orgonaépítő, és ezt bővítik 1773-74-ben.

A Szent István-dóm az óváros legmagasabb pontján található. Nehéz barokk stukkói és meseszép freskói, mind olasz mesteremberek munkái, akik az 1662-es tűzvész után kezdtek nagy munkába.

A világhírű orgonának, amely a székesegyházban található 17 974 sípja, 233 regisztere, és négy harangjátéka van. Az óriás orgona öt egységét egyszerre is lehet működtetni, amely gigantikus látványt, és mindent elsöprő akusztikai élvezetet nyújt.

A dómban külön idegenvezetést is igényelhetünk, márciustól egészen októberig magyar nyelven is. Ugyanitt orgonakoncerteket is hallgathatunk, minden csütörtök este fél nyolckor, mindössze 5 euróért.

A Niederburg kolostorban nyugszik Szent István királyunk felesége Gizella.

Az orgonát 1864-ben építették, majd 1912-ben, 1964-ben és 2000-ben korszerűsítették. Nagyság, hangzás és technika tekintetében is az ország legjelentősebb orgonái közé tartozik.